Ամսագրի կամ հրապարակման վերնագիր:

Математические вопросы кибернетики и вычислительной техники=Կիբեռնետիկայի և հաշվողական տեխնիկայի մաթեմատիկական հարցեր=Mathematical problems of computer science

Հրապարակման ամսաթիւ:

2025

Հատոր:

63

Լրացուցիչ տեղեկութիւն:

կապին հետեւելուն համար սեղմէ հոս

Ծածկոյթ:

81-101

Ամփոփում:

Root-mean-square deviation (RMSD) is a crucial metric for quantifying molecular structure similarity. However, the associated combinatorial challenges complicate the calculation process when dealing with highly symmetric molecules. Although several opensource tools have been developed to perform symmetry-corrected RMSD computations, each has limitations in terms of speed, accuracy, or usability. In this paper, we introduce FlashRMSD, a novel, rapid approach for symmetry-corrected RMSD calculation. In addition, we present an extensive benchmark dataset to evaluate RMSD calculation tools and provide a comparative analysis of existing methods alongside our proposed tool.

Հրատարակիչ:

Изд-во НАН РА

Ձեւաչափ:

pdf

Նոյնացուցիչ:

oai:arar.sci.am:405373

Բնօրինակին գտնուելու վայրը:

ՀՀ ԳԱԱ Հիմնարար գիտական գրադարան