Օբյեկտ

Վերնագիր: FlashRMSD: An Effective Approach for Symmetry-Corrected RMSD Calculation with Extensive Benchmark Analysis

Ստեղծողը:

Altunyan, Vahagn N.

Տեսակ:

Журнал

Ամսագրի կամ հրապարակման վերնագիր:

Математические вопросы кибернетики и вычислительной техники=Կիբեռնետիկայի և հաշվողական տեխնիկայի մաթեմատիկական հարցեր=Mathematical problems of computer science

Հրապարակման ամսաթիվ:

1963-

Հատոր:

63

Լրացուցիչ տեղեկություն:

սեղմիր այստեղ կապին հետևելու համար

Ծածկույթ:

81-101

Ամփոփում:

Root-mean-square deviation (RMSD) is a crucial metric for quantifying molecular structure similarity. However, the associated combinatorial challenges complicate the calculation process when dealing with highly symmetric molecules. Although several opensource tools have been developed to perform symmetry-corrected RMSD computations, each has limitations in terms of speed, accuracy, or usability. In this paper, we introduce FlashRMSD, a novel, rapid approach for symmetry-corrected RMSD calculation. In addition, we present an extensive benchmark dataset to evaluate RMSD calculation tools and provide a comparative analysis of existing methods alongside our proposed tool.

Հրատարակիչ:

Изд-во НАН РА

Ձևաչափ:

pdf

Նույնացուցիչ:

oai:arar.sci.am:405373

Բնօրինակի գտնվելու վայրը:

ՀՀ ԳԱԱ Հիմնարար գիտական գրադարան

Օբյեկտի հավաքածուներ:

Վերջին անգամ ձևափոխված:

Aug 7, 2025

Մեր գրադարանում է սկսած:

Aug 7, 2025

Օբյեկտի բովանդակության հարվածների քանակ:

0

Օբյեկտի բոլոր հասանելի տարբերակները:

https://arar.sci.am/publication/437405

Ցույց տուր նկարագրությունը RDF ձևաչափով:

RDF

Ցույց տուր նկարագրությունը OAI-PMH ձևաչափով։

OAI-PMH

Օբյեկտի տեսակ՝

Նման

Այս էջը օգտագործում է 'cookie-ներ'։ Ավելի տեղեկատվություն