Publication Details:

Լույս է տեսնում 1966 թվականից՝ տարին 4 անգամ։

Journal or Publication Title:

ՀՀ ԳԱԱ Տեղեկագիր: Ֆիզիկա = Proceedings of the NAS RA: Physics

Date of publication:

2021

Volume:

56

Number:

4

ISSN:

0002-3035

Official URL:

Additional Information:

Ասատրյան Ա. Վ., Քալաշյան Ա. Կ., Մորոզով Վ. Ֆ., Asatryan A. V., Kalashyan A. K., Morozov V. F.

Other title:

ՊՇԸՄ-ի (GMPC) շրջանակներում հետերոպոլիմերներում պարույր-կծիկ անցման նկարագրությունը ; Description of Helix-Coil Transitionin Heteropolymers in Frame of Gmpc

Contributor(s):

Պատ․ խմբ․՝ Գ․ Մ․ Ղարիբյան (1966-1992) ; Գլխ․ խմբ․՝ Վ․ Մ․ Հարությունյան (1993-2021) ; Կ․ Մ․ Ղամբարյան (2022-)

Coverage:

582–591

Abstract:

Работа посвящена изучению поведения гетерогенных биополимеров при плавлении вторичной структуры. Генерируется случайный бимодальный биополимер. Каждому компоненту соответствует своя трансферматрица ОМПЦ (GMPC), перемножением которых вычисляется свободная энергия системы. Показано, что при длине 5000 повторяющихся единиц приведенная свободная энергия не зависит от реализации последовательности (первичной структуры). Соответствующие кривые денатурации показывают, что точка перехода достаточно хорошо определяется, как линейная комбинация соответствующих гомо полимеров, однако профиль кривых зависит от реализации. Вычислена поведение числа стыков между спиральным и клубкообразным состояниями. Получен неожиданный результат, что рацемический гетерополимер длиной в 5000 повторяющихся единиц в процессе плавления разбивается на порядка 10 участков. Мы это связываем с поведением корреляции в системе, что и будет исследоваться далее.
The work is devoted to the study of the behavior of heterogeneous biopolymers during the melting of the secondary structure. A random bimodal biopolymer is generated. Each component corresponds to its own transfer-matrix of GMPC, by multiplying these transfermatrices the free energy of the system is calculated. It is shown that for a length of 5000 repeating units, the reduced free energy does not depend on the realization of the system (primary structure). The corresponding denaturation curves show that the transition point is well defined as a linear combination of the corresponding homopolymers, but the profile of the curves depends on the implementation. The behavior of the number of junctions between the helical and coiled states is calculated. An unexpected result is obtained that the racemic heteropolymer with a length of 5000 repeated units is divided into about 10 sections during the melting process. We associate this with the behavior of correlation in the system, which will be investigated further.

Format:

pdf

Identifier:

oai:arar.sci.am:289085

Call number:

АЖ 415

Location of original object:

ՀՀ ԳԱԱ Հիմնարար գիտական գրադարան