Computational modeling of two-enzyme reaction chain in presence of various types of inhibitors

A. G. Takgyozyan; Gevorgyan, A. E.; V. B. Arakelyan; E. S. Gevorgyan

Ներբեռնել

Վերնագիր: Computational modeling of two-enzyme reaction chain in presence of various types of inhibitors

Volume:

Number:

ISSN:

0366-5119

Official URL:

Other title:

Տարբեր տիպի ինհիբիտորների առկայությամբ երկֆերմենտային ռեակցիաների շղթայի համակարգչային մոդելավորումը; Компьютерное моделирование реакций двухферментной цепи при наличии ингибиторов разных видов

Contributor(s):

Պատ․ խմբ․՝ Մ․ Գ․ Թումանյան (1948) ; Գ․ Հ․ Բաբաջանյան (1949-1954) ; Հ․ Գ․ Բատիկյան (1954-1977) ; Գլխ․ խմբ․՝ Է․ Գ․ Աֆրիկյան (1978-2007) ; Է․ Ս․ Գևորգյան (2008-2023) ; Ա․ Ա․ Առաքելյան (2023-)

Coverage:

42-50

Abstract:

The paper investigates the behaviour of different types of inhibitors within the two-enzyme reaction chain compared to the kinetics of the chain without any inhibitor present. The simulation was implemented based on four models constructed using “Stella” Dynamic Modeling Package. The models are tested using the same value of initial concentrations of substrate, enzymes and inhibitors and comparative analysis of the concentration changes of parameters are presented. The paper draws several valuable conclusions on the behaviour of competitive, incompetitive and non-competitive inhibitors in the two-enzyme reaction chain. Աշխատանքում ուսւմնասիրվում է տարբեր տիպի ինհիբիտորների վարքը երկֆերմենտային ռեակցիաների շղթայում` համեմատելով այն ինհիբիտոր չպարունակող շղթայի վարքի հետ: Համակարգչային մոդելավորումը իրականացվել է “Stella” դինամիկ մոդելավորման փաթեթով: Մոդելները փորձարկվել են սուբստրատի, ֆերմենտների և ինհիբիտորների միևնույն սկզբնական արժեքների ներմուծմամբ: Կատարվել է տարբեր պարամետրերի կոնցենտրացիաների փոփոխման համեմատական վերլուծություն և ներկայացվել են երկֆերմենտային շղթայում մրցակցային, ոչ մրցակցային և անմրցակցային ինհիբիտորների վարքը բնութագրող մի քանի եզրակացություններ: Работа посвящена исследованию кинетики разных видов ингибиторов в двухферментной цепи по сравнению с поведением цепи без наличия ингибитора. Компьютерное моделирование осуществлено с помощью пакета динамического моделирования “Stella”. Построенные модели апробированы введением одинаковых начальных значений концентраций субстрата, ферментов и ингибиторов. Сравнительный анализ результатов привел к ряду выводов относительно кинетики конкурентного, неконкурентного и безконкурентного ингибирования в двухферментной цепи реакций.