Ինտերկալյատորների հետpoly(rA)-poly(rU) սինթետիկ պոլինուկլեոտիդի փոխազդեցության թերմոդի-նամիկան ; Thermodynamics of theInteraction of Synthetic Polynucleotide Poly(rA)-Poly(rU) with Intercalators
Իրականացվել է poly(rA)-poly(rU)-ի և ինտերկալյատորներ ՄԿ-ի ու ԷԲ-ի հետ նրա կոմպլեքսների հալում լուծույթի 0.02, 0.04 և 0.1 Մ իոնական ուժերի պայմաններում: Ցույց է տրվել, որ այս պոլինուկլեոտիդն ունի ոչ կայուն եշ-կառուցվածք 0.02 Մ իոնական ուժի դեպքում, և ձեռք է բերում ավելի կայուն կառուցվածք նշված լիգանդների հետ կոմպլեքսագոյացման դեպքում: Լուծույթի իոնական ուժի աճը նաև հանգեցնում է այս պոլինուկլեոտիդի եշ-կառուցվածքի կայունացմանը, ինչի արդյունքում ՄԿ-ի և ԷԲ-ի փոխազդեցությունը այս պոլինուկլեոտիդի հետ դառնում է ավելի նախընտրելի ու թերմոդինամիկորեն ավելի ձեռնտու: Ցույց է տրվել, որ լուծույթի 0.1 Մ իոնական ուժի դեպքում poly(rA)-poly(rU)-ն ընդունում է այնպիսի կառուցվածք, որ ավելի քիչ է հասանելի դառնում երկու լիգանդների ինտերկալյացիայի համար և ՄԿ-ի դեպքում հիմնականը դառնում է կիսաինտերկալյացիայի եղանակով կապումը, այն դեպքում, երբ ԷԲ-ի փոխազդեցության ժամանակ այս լիգանդին բնորոշ կապման բոլոր ձևերը ի հայտ են գալիս: Նաև ցույց է տրվել, որ ԷԲ-ի դեպքում H-ի և S-ի արժեքներն աճում են, ՄԿ-ի դեպքում՝ դրանք աճում են, ապա նվազում լուծույթի իոնական ուժի աճի դեպքում: The melting of poly(rA)-poly(rU) and its complexes with the intercalators – methylene blue (MB) and ethidium bromide (EtBr) has been carried out at the ionic strength of the solution 0.02, 0.04 and 0.1 M. This polynucleotide was revealed to have non-stable double-stranded structure at the ionic strength 0.02 M and it becomes more stable at the complex-formation with the mentioned ligands. The increase of the solution ionic strength also results in stabilization of double-stranded structure of the polynucleotide, in consequence of which the interaction of MB and EtBr with poly(rA)-poly(rU) becomes more preferable and thermodynamically more beneficial. It was shown that at the ionic strength 0.1 M poly(rA)-poly(rU) takes a structure that is more available to the intercalation of both ligands. In the case of MB the main binding mode becomes semi-intercalation, while in the case of EtBr all intrinsic binding modes are displayed. It was also shown that in the case of EtBr the values of H and S increase, while in the case of MB those values increase, then decrease at the enhancement of the ionic strength of the solution.
oai:arar.sci.am:167881
ՀՀ ԳԱԱ Տեղեկագիր: Ֆիզիկա = Proceedings of the NAS RA: Physics
Jul 20, 2020
Jun 19, 2020
1
https://arar.sci.am/publication/184726
Հրատարակության անուն | Ամսաթիվ |
---|---|
Вардеванян, П. О., Термодинамика взаимодействия синтетического полинуклеотида poly(rA)-poly(rU) с лигандами-интеркаляторами | Jul 20, 2020 |
П. О. Вардеванян А. П. Антонян М. А. Парсаданян Р. А. Карапетян М. А. Шагинян
А. П. Антонян М. А. Шагинян К. В. Пирумян П. О. Вардеванян
Г. А. Паносян Р. Р. Вардапетян П. О. Вардеванян
В. Б. Аракелян М. А. Элизбарян П. О. Вардеванян
А. Ш. Абрамян Э. С. Геворкян П. О. Вардеванян Г. А. Паносян
Л. А. Минасбекян И. С. Даниелян Дж. В. Гарибян П. О. Вардеванян Г. А. Паносян