Էնոլազի և Ֆոսֆոգլիցերատ մուտազի փոխազդեցության համակարգչային մոդելավորում

Computer Modeling of Monomeric and Dimeric Enolase Interaction with Phosphoglycerate Mutas. Компьютерное моделирование взаимодействия энолазы и фосфоглицерат мутазы.

Դ. Է. Հակոբյան ; Կ. Բ. Նազարյան

Պատ․ խմբ.՝ Վ. Հ․ Համբարձումյան (1944-1959) ; Մ․ Մ․ Ջրբաշյան (1960-1965) ; Ա․ Գ․ Նազարով (1966-1983) ; Պատ․ խմբ․ տեղակալ՝ Վ․ Հ․ Ղազարյան (1983-1986) ; Պատ․ խմբ․՝ Դ․ Մ․ Սեդրակյան (1987-1999) ; Գլխավոր խմբ․՝ Ս․ Ա․ Համբարձումյան (2000-2004) ; Վ․ Ս․ Զաքարյան (2005-2018)

Biology ; Science ; Natural history ; Chemistry

Hakobyan D. E. ; Nazaryan K. B. ; Акопян Д. Э. ; Назарян К. Б.

283-287

Glycolytic enzymes are responsible for conversion of glucose to pyruvate. It is well known that glycolytic enzymes can form dynamic complexes and substrate channeling in such complexes may take place. A number of in vitro methods have been used to investigate interaction between enolase and phosphoglycerate mutase. To determine whether this interaction is “visible” with the help of computer modeling method, two different enolases have been chosen from available protein data banks. Saccharomyces Cerevisiae (Sc.) phosphoglycerate mutase and Sc. enolase dimers together with Trypanosoma brucei (TB) enolase monomer have been tested for interaction. Analysis showed that 70% of most active binding amino acid residues of TB enolase are identical to residues of yeast enolase. Nevertheless no channeling has been observed. Известно, что ферменты энолаза и фосфоглицерат мутаза участвуют в прямом и обратном превращении глюкозы в пируват. Проведен ряд in vitro экспериментов для выявления и исследования свойств взаимодействия этих ферментов, а также регистрации “метаболического канала”. Компьютерное моделирование является новым и многообещающим методом для та- кого рода исследований. Рассмотрено взаимодействие дрожжевой энолазы и энолазы, выделенной из организма Trypanosoma brucei с дрожжевой фосфоглицерат мутазой. Показано, что самые активные аминокислотные остатки энолазы от Trypanosoma brucei на 70% совпадают с аминокислотными остатками дрожжевой энолазы, что может свидетельствовать о специфичности взаимодействия этих ферментов. Несмотря на наличие взаимодействия, эффект “метаболического канала” не выявлен.

Երևան

ՀՀ ԳԱԱ Հիմնարար գիտական գրադարան