Publication Details:
Journal or Publication Title:
Հայաստանի կենսաբանական հանդես =Biological Journal of Armenia
Date of publication:
Volume:
Number:
ISSN:
Official URL:
Title:
Study of Molecular Dynamics of Lamellar Phase of Amphiphile/Water Systems
Other title:
Creator:
Contributor(s):
Պատ․ խմբ․՝ Մ․ Գ․ Թումանյան (1948) ; Գ․ Հ․ Բաբաջանյան (1949-1954) ; Հ․ Գ․ Բատիկյան (1954-1977) ; Գլխ․ խմբ․՝ Է․ Գ․ Աֆրիկյան (1978-2007) ; Է․ Ս․ Գևորգյան (2008-2023) ; Ա․ Ա․ Առաքելյան (2023-)
Subject:
Uncontrolled Keywords:
Պողոսյան Ա. Հ. ; Погосян А. Г. ; мolecular dynamics (MD) simulations ; alkyl sulfonates
Coverage:
Abstract:
The lamellar phase of amphiphile/water system was investigated by using atomic scale simulation. A 300 ns parallel molecular dynamics (MD) simulation was carried out for amphi-phile/water system consisting of 128 sodium pentadecyl sulfonate (SPDS) and 2251 water molecules using GROMACS software package. At T=323K temperature we got both tilted fully interdigitated and liquid crystalline like disordered hydrocarbon chains, i.e. we observe a gel phase that coexists with a lamellar Lα phase. Ուսումնասիրվել է երկսեր նյութ/ջուր լամելային փուլը օգտագործելով ատոմական մակարդակի համակարգչային մոդելավորում: Իրականացվել է 300 նվ զուգահեռ մոլեկուլային դինամիկ ուսումնասիրություն որպես համակարգ վերցնելով` երկսեր նյութ/ջուր համակարգը, բաղկացած 128 նատրիումի պենտադեցիլ սուլֆոնատի և 2251 ջրի մոլեկուլներից օգտագործելով GROMACS ծրագրային փաթեթը: T=323K ջերմաստիճանի դեպքում, ստացվել են պոչերի իրար մեջ լրիվ ներթափանցում, ինչպես նաև հեղուկ բյուրեղական չկարգավորված պոչեր, այսինքն դիտվել է «գել» փուլ, որը համագոյակցում է լամելային Lα փուլի հետ: При помощи компьютерного моделирования на атомарном уровне была исследована ламелярная фаза системы амфифильное вещество/вода. Была проведена параллельная молекулярно-динамическая (МД) симуляция длительностью 300 нс для системы, состоящей из 128 молекул пентадецил сульфоната натрия (ПДСН) и 2251 молекулы воды, с использованием программного пакета GROMACS. При температуре T=323K мы получили как наклоненные полностью взаимопроникающие, так и жидко-кристаллические неупорядоченные углеводородные цепи, то есть наблюдалось сосуществование гель и ламелярной Lα фаз.
Place of publishing:
Երևան