Обобщенная модель полипептидной цепи при наличии ограничения на длину спирального участка

Պոլիպեպտիդային շղթայի ընդհանրացված մոդելը պարուրային տեղամասի երկարության վրա սահմանափակման առկայության դեպքում; Generalized model of polypeptide chain with limitations on the length of helical fractions

Ш. А. Тоноян ; Г. Н. Айрапетян ; А. В. Царукян ; Е. Ш. Мамасахлисов ; В. Ф. Морозов

Պատ․ խմբ․՝ Գ․ Մ․ Ղարիբյան (1966-1992) ; Գլխ․ խմբ․՝ Վ․ Մ․ Հարությունյան (1993-2021) ; Կ․ Մ․ Ղամբարյան (2022-)

Physics ; Science ; Chemical Physics

Տոնոյան Շ. Ա. ; Հայրապետյան Գ. Ն. ; Ծառուկյան Ա. Վ. ; Մամասախլիսով Ե. Շ. ; Մորոզով Վ. Ֆ. ; Tonoyan Sh. A. ; Hayrapetyan G. N. ; Tsarukyan A. V. ; Mamasakhlisov Y. Sh. ; Morozov V. F.

311-318

Предложена модель с гамильтонианом, состоящим из двух слагаемых, соответствующих гамильтонианам Обобщенной Модели Полипептидной Цепи (ОМПЦ), с различными масштабами взаимодействия. Рассмотрен случай, когда крупномасштабное взаимодействие соответствует отталкиванию, в то время, когда мелкомасштабное взаимодействие соответствует притяжению, что моделирует плавление системы в условиях компактной упаковки (глобуля ризованный полипептид или ДНК в капсиде). Առաջարկված է մոդել՝ երկու գումարելիներից կազմված համիլտոնյանով, որոնք համապատասխանում են փոխազդեցության տարբեր մասշտաբներով ՊՇԸՄ համիլտոնյաններին։ Դիտարկված է դեպք, երբ մեծամասշտաբ փոխազդեցությունները համապատասխանում են վանողությանը, մինչդեռ փոքրամասշտաբ փոխազդեցությունները համապատասխանում են ձգողությանը, ինչը համապատասխանում է համակարգի հալմանը կոմպակտ փաթեթավորման պայմաններում (գլոբուլացված պոլիպեպտիդ կամ ԴՆԹ կապսիդում): A model with the Hamiltonian which consists of two parts corresponding to the Hamiltonian of GMPC with different scales of interaction is proposed. The case when long-scale interactions correspond to attraction is considered while short-scale interactions correspond to repulsion. This corresponds to the system melting in compact packing (globulized polypeptide or DNA in capsid).

ՀՀ ԳԱԱ Հիմնարար գիտական գրադարան